Der Verwaltungsrat ist das für alle Angelegenheiten des Zukunftsfonds verantwortliche Organ, das den Zukunftsfonds nach außen und gegenüber den beiden Regierungen vertritt. Als unabhängiges Gremium trifft er alle seine Entscheidungen in eigener Verantwortung. Er entscheidet frei über die Verteilung der Fondsmittel und verantwortet seine Haushaltsführung gegenüber den Regierungen beider Länder als den Stiftungsgründern.
Über die im Sekretariat eingehenden Projektanträge entscheidet er frei anhand der von ihm beschlossenen Kriterien.
Die vier deutschen und vier tschechischen Mitglieder des Verwaltungsrats werden für jeweils zwei Jahre von den zuständigen Außenministern ernannt, ihre Mitgliedschaft ist ehrenamtlich und unentgeltlich.
Das Amt des Vorsitzenden und stellvertretenden Vorsitzenden wird jährlich gewechselt.
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2010/2011
Klaus Brämig Mitglied des Bundestages (CDU-Sachsen) , Vorsitzender der Gruppe der Vertriebenen, Flüchtlinge und Aussiedler der CDU/CSU-Bundestagsfraktion
Reiner Deutschmann Mitglied des Bundestages (FDP-Sachsen), kulturpolitischer Sprecher der FDP-Bundestagsfraktion
Kristina Larischová Wissenschaftliche Mitarbeiterin der Prager Vertretung der Friedrich-Ebert-Stiftung, ehemalige Stellvertreterin des Direktors am Institut für Internationale Beziehungen Prag
Jarmila Neumannová Managerin für externe Kommunikation der Assoziation der Hospiz- und Palliativpflegeanbieter (ČR), ehemalige Direktorin des Stiftungsfonds für Holocaustopfer,
Franz Olbert Ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde, München
Otto Pick Sonderbotschafter des Außenministeriums der Tschechischen Republik, ehemaliger Stellvertretender Außenminister der Tschechischen Republik und Direktor des Institutes für Internationale Beziehungen Prag
Albrecht Schläger Vorsitzender der Seliger Gemeinde, ehemaliges Mitglied des Bayerischen Landtages (SPD) und ehemaliger Bürgermeister von Hohenberg
Tomáš Sedláček Ökonom, Pädagoge, leitender makroökonomischer Analytiker der ČSOB Bank
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2008/2009
Heinz-Peter Haustein Mitglied des Bundestages (FDP)
Michael Kretschmer Mitglied des Bundestages (CDU/CSU)
René Kubášek Berater des Außenministers der Tschechischen Republik Karel Schwarzenberg
Kristina Larischová wissenschaftliche Mitarbeiterin der Prager Vertretung der Friedrich Ebert Stiftung, ehemalige Stellvertreterin des Direktors am Institut für Internationale Beziehungen Prag
Jarmila Neumannová Koordinatorin für Projekte des Stiftungsfonds des Tschechischen Rundfunks, ehemalige Direktorin des Stiftungsfonds für Holocaustopfer,
Franz Olbert ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde, München
Otto Pick Sonderbotschafter des Außenministeriums der Tschechischen Republik, ehemaliger Stellvertretender Außenminister der Tschechischen Republik und Direktor des Institutes für Internationale Beziehungen Prag
Albrecht Schläger Vorsitzender der Seliger Gemeinde, ehemaliges Mitglied des Bayerischen Landtages (SPD) und ehemaliger Bürgermeister von Hohenberg
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2006/2007
Heinz-Peter Haustein Mitglied des Bundestages (FDP)
Michael Kretschmer Mitglied des Bundestages (CDU/CSU)
Kristina Larischová wissenschaftliche Mitarbeiterin der Prager Vertretung der Friedrich Ebert Stiftung, ehemalige Stellvertreterin des Direktors am Institut für Internationale Beziehungen Prag
Franz Olbert ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde, München
Otto Pick Sonderbotschafter des Außenministeriums der Tschechischen Republik, ehemaliger Stellvertretender Außenminister der Tschechischen Republik und Direktor des Institutes für Internationale Beziehungen Prag
Miloš Pojar ehemaliger Botschafter der Tschechischen Republik in Israel, Beauftragter für den Vorsitz der Tschechischen Republik im Internationalen Ausschuss für die Zusammenarbeit bei Forschung, Bildung und Gedenken an den Holocaust (Task Force for International Cooperation on Holocaust Education, Remembrance and Research)
Albrecht Schläger Vorsitzender der Seliger Gemeinde, ehemaliges Mitglied des Bayerischen Landtages (SPD) und ehemaliger Bürgermeister von Hohenberg
Pavel Smetana ehemaliger Synodalsenior der Evangelischen Kirche der Böhmischen Brüder und Vorsitzender des Ökumenischen Rates der Kirchen in der Tschechischen Republik
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2004/2005
Helmut Bilstein
Staatsrat a.D. der Freien und Hansestadt Hamburg und ehemaliger Beauftragter Hamburgs in der Tschechischen Republik (Prag), Vorsitzender des Verwaltungsrats 2004
Dr. Dagmar Burešová
Justizministerin a.D. und ehemalige Vorsitzende des Tschechischen Nationalrats der ČSFR, Vorsitzende des Verwaltungsrats für das Jahr 2005
Albrecht Schläger
ehemaliges Mitglied des Bayerischen Landtages, verkehrspolitischer Sprecher der SPD im Bayerischen Landtag und ehemaliger Bürgermeister von Hohenberg
Prof. Dr. Jan Křen
Historiker, ehem. Vorsitzender des tschechischen Teils der Deutsch-Tschechischen Historikerkommission, Universitätsprofessor
Dr. Miroslav Kunštát
Historiker, Mitarbeiter des Instituts für Internationale Studien der Fakultät für Sozialwissenschaften der Karlsuniversität Prag
Franz Olbert
ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde, München
Dr. Miloš Pojar
ehemaliger Botschafter der Tschechischen Republik in Israel, Leiter des Kultur- und Bildungszentrums des Jüdischen Museums, Prag
Dr. Antje Vollmer
Theologin, Pädagogin, Publizistin, Vizepräsidentin des Deutschen Bundestags (Bündnis 90/Die Grünen)
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2002/2003
Dr. Dagmar Burešová
Justizministerin a.D. und ehemalige Vorsitzende des Tschechischen Nationalrats der ČSFR, Vorsitzende des Verwaltungsrats 2003
Helmut Bilstein
Staatsrat a.D. der Freien und Hansestadt Hamburg und ehemaliger Beauftragter Hamburgs in der Tschechischen Republik (Prag), Vorsitzender des Verwaltungsrats 2002
Volkmar Gabert
(verstorben am 19.2.2003) ehemaliger Vorsitzender der SPD Bayern, ehemaliges Mitglied des Landtags und des Europaparlaments, Vorsitzender der Seliger-Gemeinde (Gesinnungsgemeinschaft sudetendeutscher Sozialdemokraten)
Albrecht Schläger
(ab 3/2003) ehemaliges Mitglied des Bayerischen Landtages, verkehrspolitischer Sprecher der SPD im Bayerischen Landtag und ehemaliger Bürgermeister von Hohenberg
Prof. Dr. Jan Křen
Historiker, ehem. Vorsitzender des tschechischen Teils der Deutsch-Tschechischen Historikerkommission, Universitätsprofessor
Dr. Miroslav Kunštát
Historiker, Mitarbeiter des Instituts für Internationale Studien der Fakultät für Sozialwissenschaften der Karlsuniversität Prag
Franz Olbert
ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde, München
Dr. Miloš Pojar
ehemaliger Botschafter der Tschechischen Republik in Israel, Leiter des Kultur- und Bildungszentrums des Jüdischen Museums, Prag
Dr. Antje Vollmer
Theologin, Pädagogin, Publizistin, Vizepräsidentin des Deutschen Bundestags (Bündnis 90/Die Grünen)
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 2000/2001
Dr. Dagmar Burešová
Justizministerin a.D. der ČSFR und ehemalige Vorsitzende des Tschechischen Nationalrats der ČSFR, Vorsitzende des Verwaltungsrats 2001
Helmut Bilstein
Staatsrat a.D. der Freien und Hansestadt Hamburg und ehemaliger Beauftragter Hamburgs in Sachsen (Dresden) sowie in der Tschechischen Republik (Prag), Vorsitzender des Verwaltungsrats 2000
Volkmar Gabert
ehemaliger Vorsitzender der SPD Bayern, ehemaliges Mitglied des Landtags und des Europaparlaments, Vorsitzender der Seliger-Gemeinde (Gesinnungsgemeinschaft sudetendeutscher Sozialdemokraten)
Prof. Dr. Jan Křen
Historiker, ehem. Vorsitzender des tschechischen Teils der Deutsch-Tschechischen Historikerkommission, Universitätsprofessor
Dr. Miroslav Kunštát
Historiker, Mitarbeiter des Instituts für Internationale Studien der Fakultät für Sozialwissenschaften der Karlsuniversität Prag
Franz Olbert
ehemaliger Generalsekretär der Ackermann-Gemeinde (Zusammenschluss katholischer sudetendeutscher Vertriebener)
Dr. Miloš Pojar
ehemaliger Botschafter der Tschechischen Republik in Israel, Leiter des Kultur- und Bildungszentrums des Jüdischen Museums
Dr. Antje Vollmer
Theologin, Pädagogin, Publizistin, Vizepräsidentin des Deutschen Bundestags (Bündnis 90/Die Grünen)
Die Mitglieder des Verwaltungsrates 1998/1999
Dr. Dagmar Burešová
Justizministerin a.D. der ČSFR und ehemalige Vorsitzende des Tschechischen Nationalrats der ČSFR, Vorsitzende des Verwaltungsrats 1999
Dr. Anton Roßbach
ehemaliger Botschafter der Bundesrepublik in der Tschechischen Republik, Vorsitzender des Verwaltungsrats 1998
Johann Böhm
Präsident des Bayerischen Landtags (CSU)
Volkmar Gabert
ehemaliger Landesvorsitzender der SPD Bayern, ehemaliges Mitglied des Landtags und des Europaparlaments, Vorsitzender der Seliger-Gemeinde (Gesinnungsgemeinschaft sudetendeutscher Sozialdemokraten)
Dr. Max Stadler
Bundestagsabgeordneter (FDP), ehemaliger Landesvorsitzender Bayern
Dr. Miroslav Kunštát
Historiker, ehemaliger Mitarbeiter der politischen Abteilung in der Kanzlei des Staatspräsidenten, Mitarbeiter des Instituts für Internationale Studien der Fakultät für Sozialwissenschaften der Karlsuniversität Prag
Dr. Miloš Pojar
ehemaliger Botschafter der Tschechischen Republik in Israel, Leiter des Kultur- und Bildungszentrums des Jüdischen Museums, Prag
Miloš Rejchrt
evangelischer Geistlicher, Leiter der Abteilung religiöse Sendungen des Tschechischen Rundfunks, zeitweise Mitglied des Aufsichtsrats des Tschechischen Fernsehens |